Medio 1900 ontwikkelde het dorp Baarn zich tot een fraai ogende gemeente met enkele villawijken. Rond 1918 begon een aantal ouders in Baarn te denken aan de oprichting van een plaatselijk lyceum. Het verzoek om een gemeentelijk lyceum werd om financiële redenen afgewezen. Op eigen initiatief werd op 4 april 1919 een bijzondere school op algemene grondslag opgericht, genaamd Het Baarnsch Lyceum.
Voor € 70.000,- kocht men de villa Waldheim, strategisch gelegen bij het station. Op 3 september 1919 begon het eerste schooljaar met 32 leerlingen (23 eerste- en 9 tweedejaars) en 10 leraren onder leiding van rector dr. J.A. Vor der Hake. Op 1 september 1920 waren er 70 leerlingen en het aantal bleef stijgen, zodat men ruimte te kort kwam. Er werden een lesvleugel en een aula gebouwd.
In 1924 startte men een schoolkrant, de Animo. In 1926 richtten leerlingen een schoolvereniging, de B.L.V, op. Sinds dat jaar kiezen de leerlingen hun vertegenwoordigers, de Seniores. Tijdens de Tweede Wereldoorlog werd het schoolgebouw door de Duitsers gevorderd, zodat er op verscheidene locaties les moest worden gegeven. Vele oud-leerlingen gaven door deelname aan het verzet hun leven voor onze vrijheid. In de huidige en straks de nieuwe school hangt een gedenkplaat met hun namen.
Rond 1960 neemt het aantal leerlingen uit Baarn en Soest flink toe. In mei 1969 werd het nieuwe, grotere schoolgebouw aan de Torenlaan feestelijk geopend door koningin Juliana. In juni 2008 startte de bouw van een nieuw schoolgebouw op de sportvelden.
Sinds oktober 2010 huist de school aan de Torenlaan 83 en deelt het scholencomplex met de Waldheim-mavo. Ons schoolgebouw kenmerkt zich door een modern aanbod van faciliteiten en ontwikkelingsmogelijkheden, denk aan de meest up to date ict-voorzieningen, uitgebreide sportvoorzieningen en een prettig leer- en lesklimaat. Tegelijkertijd zijn oude waarden en het gedachtegoed behouden. Zo is het historisch erfgoed overgeplaatst en hebben de Escher-zuilen en Waldheim-pilaren weer een prominente plek gekregen in en rondom het gebouw.
Het Baarnsch Lyceum is er trots op zo’n mooie school gerealiseerd te hebben.
Op 25 oktober 2011 heeft Hare Majesteit de Koningin het scholencomplex feestelijk geopend met de onthulling van de plaquette bij de Kom van Oranje.